龙眼菩提和凤眼菩提都是备受喜爱的菩提子种类，它们在外观、产地、寓意以及用途上存在诸多区别。
从外观上看，龙眼菩提的芽眼呈三角形或方形，类似三角眼，其表面有较为明显的纹理，整体形状多为椭圆形，颜色以褐黄色为主，而凤眼菩提的芽眼则更像眼睛，通常为圆形或椭圆形，被称为“凤眼”，颜色多为黄褐色，纹理相对细腻。
产地方面，龙眼菩提主要产于印度、尼泊尔、孟加拉国等地，其中印度的龙眼菩提最为珍贵，凤眼菩提则主要产于尼泊尔海拔一千米的区域，国内也有大规模嫁接种植，但品质与尼泊尔所产相比稍逊一筹。
在寓意上，龙眼菩提在佛教中象征着驱邪、增强智慧、镇宅等，还代表富贵、吉祥等，如龙藏代表大乘经典，龙像代表菩萨的威仪等，凤眼菩提在藏传佛教中被视为菩提子中的智者，持戴凤眼菩提可增长人的智慧，能使念诵的功德增长千万倍。
用途上，二者都常被制成佛珠用于修行、念诵等宗教活动，也可用于装饰、把玩等，不过由于其品质和稀缺性不同，在市场上的价值也有所差异，品相较好的凤眼菩提价格相对较高。
